�。�1）水文情勢發(fā)生改變。水庫對水文情勢的直接影響是改變了下游河道水量分配過(guò)程，水量的年內變化趨于平坦。下游河道原有的水文節律被打破。Lauterbach等人研究發(fā)現，歐洲中部許多河流受水庫的調節，50年一遇的洪水流量減少20％。美國科羅拉多河格倫峽水庫下游10年一遇的洪流流量減少了75％。部分水庫蓄水未考慮下游河道生態(tài)需水要求，導致河流水生境破壞，甚至發(fā)生河道斷流。

　　同時(shí)，大壩的擋水作用改變了庫區水流條件，使庫區從急流（流水）區轉化成靜水（滯水）區。

　�。�2）水體溫度發(fā)生變化。水庫蓄水后水深增加，水體的透光性能差，熱量向下傳遞減少，庫區深水區水體溫度會(huì )下降，表現出溫度分層現象：多數水庫都有強弱不同的水溫分層現象。Orlod根據水庫的調節性能。將水庫水溫分層分為穩定分層型、混合型和過(guò)渡型。另外，由于高壩大庫一般在大壩底部泄流。下游河道水溫呈現出冬季升高和夏季降低的勻化過(guò)程。較天然過(guò)程存在滯后性，影響距離可達到數百千米。而梯級水庫對河道水溫的影響更為復雜。存在波動(dòng)性和累積性。張黎明采用數學(xué)模型計算的結果表明：三峽庫區4月～6月水體分層較強。垂向溫差大于8℃。

　�。�3）庫區納污能力減弱。水庫建成后，庫區水體流速明顯降低，污染物極易產(chǎn)生富集。李錦繡等人計算分析后認為，三峽水庫建成以后，隨著(zhù)水位抬高，流速減緩，單位時(shí)間內BOD等有機污染物降解速率明顯減小。袁弘任等認為，隨著(zhù)三峽水庫蓄水位的增加，水域納污能力逐步減少，且支流回水區末端受庫水位頂托影響，形成相對靜止的庫灣，不利于氮、磷等物質(zhì)的擴散和交換，易導致富營(yíng)養化監測結果表明，從2003年三峽水庫首次蓄水開(kāi)始，香溪河庫灣已發(fā)生多次春季水華現象。

　�。�4）水生態(tài)系統脆弱化。水庫對水生態(tài)系統的影響主要體現在三個(gè)層級：第一個(gè)層級是對生源要素的影響。因為河道水力條件的變化，直接對物質(zhì)流、能量流和信息流產(chǎn)生影響，這些都是水生生物的生源要素；第二個(gè)層級是對棲息地環(huán)境產(chǎn)生影響，主要是水流、泥沙條件發(fā)生變化以后，河道形態(tài)、泥沙沖淤過(guò)程、棲息地面積隨之發(fā)生變化：第三個(gè)層級是河流生態(tài)系統結構和功能發(fā)生變化，如水生生物種群結構、種群數量、物種密度等發(fā)生變化，這也是生源要素、棲息地環(huán)境發(fā)生變化的生態(tài)響應結果可見(jiàn)，水庫的運行，無(wú)論是對生態(tài)系統的非生命物質(zhì)環(huán)境還是對生物群落都產(chǎn)生了影響，使得水庫上下游生態(tài)系統脆弱化。