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1、要建立專(zhuān)項工程賬目管理機制

建立專(zhuān)項工程賬目，確保專(zhuān)款專(zhuān)用是對整個(gè)水利工程的建設，意義重大，有專(zhuān)門(mén)的資金管理部門(mén)，能使資金的使用率達到最大化，如小型農田水利建設資金要專(zhuān)賬、專(zhuān)戶(hù)與專(zhuān)人管理，要按工程進(jìn)度撥款，并嚴格按照相關(guān)的規定辦事，不能越級對資金的使用，而且在使用之后，有詳細的記錄。資金流轉要通過(guò)銀行轉賬或電匯，工程完工后要及時(shí)辦理竣工決算。

2、要建立工程效益審計制度

當前我國農田水利工程很少有專(zhuān)業(yè)的工程效益審計制度，這就導致其價(jià)值不能達到最大化，甚至影響了原本的價(jià)值體現。這就要求工程完工后，要抓好跟蹤審計，并組織專(zhuān)業(yè)的人員進(jìn)行文件記載，把工作中難以解決的問(wèn)題與相關(guān)解決措施及工整的清晰的記錄，認真進(jìn)行總結工作經(jīng)驗，只有這樣才可制定更好、可行的發(fā)展策略。

3、努力深化與完善農村水利改革

對現代農業(yè)，以往傳統的小面積的農田水利工程，已不在適合。對于現代農田來(lái)說(shuō)，要建造大型且功能多面化的新型水利工程，這樣才能更快的發(fā)展中國的農業(yè)。

（1）推動(dòng)小型農田水利工程產(chǎn)權制度改革健康深入發(fā)展，努力把其作為標準化的工程建設。

（2）要以水利工程為單元，通過(guò)對基層水利隊伍的改組、改造及改革與完善。

（3）培養農民群眾的水利管理專(zhuān)業(yè)知識，雇傭農民工作為工作人員，由于水利工程就是給自己家建造的，有利于自已，因此會(huì )主動(dòng)保護好工程。

4、要擴大投資

要使水利建設資金合理分配，做到區域內的平衡與和諧建設，水利建設管理部門(mén)要對現有工程進(jìn)行維修擴建與改造，以確保對農田水利基礎設施的建設，適應農村水利發(fā)展的要求。并且在增加地方財政投入的同時(shí)，地方政府也加強了對農村小型水利工程建設的行政領(lǐng)導，積極調動(dòng)組織群眾參與水利工程建設的積極性，充分發(fā)揮政府資金的引導作用，鼓勵村民投入到水利工程建設當中去，以節省人力資金，以免出現由于資金短缺使得一些重點(diǎn)工程延誤。

5、要加強對農田水利工程建設的監管力度

制定一套完善的工程建設管理制度，同時(shí)組建一個(gè)完整的質(zhì)量監督體系，自上而下，齊抓共管。農村小型農田水利工程內容廣泛，要實(shí)行統一管理，合理規劃布局，完善建設程序。建立健全資質(zhì)認證制度，落實(shí)工程招投標制度，規范施工管理，明確工程投資，實(shí)行施工準入證制度與工程監理制度，加強竣工驗收備案制度和嚴格獎懲制度，使農村中小型水利工程建設朝著(zhù)規范有序方面發(fā)展。依據各種不同農村水利的特點(diǎn)，對不同功能的水利工程采取相應的管理措施，使水利工程在完善的工程管理條件之下，取得較好的工程效益。