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過(guò)去建設的水利工程側重于滿(mǎn)足人類(lèi)社會(huì )對水的多種需求，相對忽視了維護一個(gè)健康生態(tài)系統的穩定性需求。由于水利工程可能引起河流形態(tài)的均一化和不連續化，降低了生境多樣性，對河流生態(tài)系統形成了一種脅迫，這種脅迫可能引起河流生態(tài)系統的退化，隨之也會(huì )降低河流生態(tài)系統的服務(wù)功能，最終對人們的利益造成損害。水利工程建設要正視這個(gè)問(wèn)題，以積極的態(tài)度解決這個(gè)問(wèn)題。我國為發(fā)展經(jīng)濟，作為基礎設施的水利工程將會(huì )繼續興建。未來(lái)的水利工程不僅是能夠滿(mǎn)足人們供水、灌溉、防洪、航運、發(fā)電及旅游需求的工程，也應該是有利于生態(tài)建設的環(huán)境工程。從技術(shù)層面上看，水利工程建設中保護河流多樣性問(wèn)題，似有以下幾個(gè)值得重視和研究。

①從水利工程的規劃設計的指導思想看，建設水利工程的目的不僅應滿(mǎn)足人們對水的需求，同時(shí)要滿(mǎn)足維持河流生態(tài)系統健康的需求，其中的關(guān)鍵問(wèn)題之一是盡可能地保護河流形態(tài)的多樣性。

②保持河流的蜿蜒性是保護河流形態(tài)多樣性的重點(diǎn)。在河道整治工程中，尊重天然河道形態(tài)，避免直線(xiàn)和折線(xiàn)型的河道設計。灌溉渠道設計也要注意模仿河流自然形態(tài)的特點(diǎn)。對于河流的裁彎取直工程要充分論證，持慎重態(tài)度。

③保持河流斷面形狀的多樣性，尊重河流原有的自然斷面形態(tài)。河道整治工程中應盡可能避免采用幾何規則斷面，疏浚工程施工中避免河道斷面的均一化。

④河道防護工程的岸坡采用有利于植物生長(cháng)的透水材料，特別注意采用當地天然材料，也要注意整理、發(fā)掘和發(fā)展傳統治河工法和材料。開(kāi)發(fā)和推廣供輸水渠道使用的利于植物生長(cháng)同時(shí)具有一定防滲性能的襯砌材料和施工工藝。

⑤水利工程設計應為植物生長(cháng)和動(dòng)物棲息創(chuàng )造條件。提供魚(yú)類(lèi)產(chǎn)卵條件以及鳥(niǎo)類(lèi)和水禽棲息地和避難所。建設符合生態(tài)學(xué)原理的過(guò)壩魚(yú)道。開(kāi)發(fā)新型丁壩、人工浮島及生態(tài)型城市雨洪利用系統技術(shù)。

⑥新建大壩樞紐工程要充分論證由于水庫建設改變河流生態(tài)系統為靜水生態(tài)系統的利弊得失，采取必要的補償工程措施和生物措施。

⑦開(kāi)展已建水庫的生態(tài)系統健康評估與預測。注重水庫生態(tài)系統退化的恢復及富營(yíng)養化控制問(wèn)題。通過(guò)水庫庫區生態(tài)建設及水生生物的合理結構設計，提高水庫水體自?xún)裟芰妥晕倚迯湍芰?。充分利用鄉土種生物，慎重引進(jìn)外來(lái)種，注意防止生物入侵。