監理工程師可以注冊在施工單位。

《監理工程師資格考試和注冊試行辦法》第十六條具體規定如下：

申請監理工程師注冊，由擬聘用申請者的工程建設監理單位統一向本地區或本部門(mén)的監理工程師注冊機關(guān)提出申請。

監理工程師注冊機關(guān)收到申請后，依照本辦法第十五條的規定進(jìn)行審查。對符合條件的，根據全國監理工程師注冊管理機關(guān)批準的注冊計劃擇優(yōu)予以注冊，頒發(fā)《監理工程師崗位證書(shū)》，并報全國監理工程師注冊管理機關(guān)備案。