雖然近兩年來(lái)代建制開(kāi)始全面推行，但總體上看仍處于探索和完善階段，由于思想認識不統一、規章制度不完善、實(shí)踐經(jīng)驗不足等原因，在實(shí)施過(guò)程中遇到了一些困難和阻力，急需研究解決。

　�。ㄒ唬┐�建單位的法律地位有待明確，與使用單位的責權利關(guān)系需要進(jìn)一步劃清。從目前情況看，代建單位的法律地位不明確，在辦理各種工程建設手續的過(guò)程中，其身份難以被有關(guān)行政管理部門(mén)認可，造成工作被動(dòng)。代建單位與使用單位的職責、權利和義務(wù)的劃分還不清晰，代建合同的簽訂方式和內容不規范。另外，有些使用單位對于代建工作存在一定的抵觸情緒，不是自覺(jué)自愿接受項目代建，在代建過(guò)程中或是不積極主動(dòng)配合，什么事都不管；或是不愿放棄自己的權力，過(guò)多干涉代建單位的正常工作。

　�。ǘ�）代建市場(chǎng)尚待培育，缺少水平高、專(zhuān)業(yè)性強的代建主體。 目前，各地對代建單位的資格條件和市場(chǎng)準入要求比較模糊，對代建單位的資質(zhì)認定、等級劃分等沒(méi)有明確的標準和依據。代建市場(chǎng)處于發(fā)育期，代建主體少，尤其缺少經(jīng)驗豐富、水平高的代建企業(yè)，還未形成良性的市場(chǎng)競爭。

　�。ㄈ�）代建服務(wù)計費無(wú)明確規定，標準偏低。目前各地的代建取費標準大多是參照建設單位管理費的標準來(lái)執行。但建設單位管理費與代建服務(wù)費相比存在較大差異，不包括代建單位必須支出的工資、稅金以及應該獲得的合理利潤等內容，因此費率偏低，不利于吸引優(yōu)秀企業(yè)參與代建。

　�。ㄋ模┤绾谓�立合理的代建單位激勵約束機制有持進(jìn)一步探索。許多地方對于代建項目節約投資進(jìn)行提成獎勵，其目的是鼓勵代建單位千方百計控制投資、節約建設資金。但在實(shí)施過(guò)程中，這一規定有可能對代建單位產(chǎn)生誤導，誘使代建單位為贏(yíng)取節支獎勵而偷工減料、降低建設標準，從而使工程質(zhì)量難以得到有效保證。另外有些使用單位總是要求代建單位要盡量用完批準的投資，使兩者之間產(chǎn)生利益沖突，造成工期拖延。

　�。ㄎ澹┱�府部門(mén)直接管理的組織模式，增加了日常工作量和行政風(fēng)險。各地代建制的組織模式各異，但基本都是政府有關(guān)部門(mén)直接管理代建項目的組織實(shí)施，這使得主管部門(mén)直接面對代建項目實(shí)施過(guò)程中的各種矛盾和問(wèn)題，過(guò)多陷于具體事務(wù)，增加了日常工作量，不利于提高工作效率。另外，有些地方還采取政府管理部門(mén)與代建單位、使用單位共同簽訂代建合同的方式，由于代建合同的內容十分詳盡和繁雜，主管部門(mén)在項目實(shí)施過(guò)程中稍不留意，就有可能因各方對合同內容理解上的差異等原因而引發(fā)仲裁或行政訴訟，加大了行政風(fēng)險。